25 января 1941 года был создан Ленинградский авиационный институт (ЛАИ), в котором была организована кафедра военной и физической подготовки.
13 апреля 1944 года было принято Постановление СНК СССР «О введении в гражданских вузах военной и военно-морской подготовки офицеров запаса».
1 октября 1945 года на 2 этаже 1 корпуса Чесменского дворца началось плановое обучение студентов по профилю подготовки офицеров запаса для авиационно-технического состава ВВС. В октябре 1948 года из программы военного обучения была исключена физическая подготовка и кафедра стала именоваться просто «военной».
В феврале 1961 года вышел в свет Приказ Министра обороны о перепрофилировании военной кафедры ЛИАП на подготовку офицеров запаса для Зенитных ракетных войск ПВО. Кафедра готовила специалистов запаса по ЗРК средней дальности С-75. Для перепрофилированной кафедры был выделен 4-й этаж 2 корпуса Чесменского дворца.
1 сентября 1963 года военная кафедра начала учебный год в здании по ул. Герцена, 67, где преподавались специальные военные дисциплины. В здании Чесменского дворца были оставлены общевоенная подготовка и Гражданская оборона.
12 июня 1985 года приказом Министра обороны СССР военная кафедра ЛИАП была перепрофилирована на подготовку офицеров запаса со специальностями по ЗРК средней дальности С-300.
18 декабря 2001 года ректором ГУАП был подписан приказ о создании в университете факультета № 7 – факультета военного образования, который объединил в себе военную кафедру, кафедру физического воспитания и спорта, а также кафедру конверсионных компьютеризированных систем.
В феврале 2002 года состоялся приказ о перепрофилировании кафедры, а с 1 сентября 2004 года военная кафедра ГУАП перешла на обучение по десяти военно-учетным специальностям для Военно-воздушных сил, Ракетных войск стратегического назначения и Космических войск. Кроме того, на кафедре началась подготовка по военным специальностям широкого межвидового применения: специалистов по аппаратуре дальней телефонной многоканальной связи и военной социологии.
21 февраля 2005 года состоялась реорганизация факультета военного образования ГУАП в пятикафедральный состав: кафедра ракетных и космических войск, кафедра военно-воздушных сил, кафедра военно-гуманитарной подготовки, кафедра физического воспитания и спорта, кафедра конверсионных компьютеризированных систем.
В июне 2005 года утверждена организационно-штатная структура военной кафедры ГУАП (объединенной) и по предложению Министерства Обороны РФ ГУАП включен в перечень вузов, на базе которых с 2008 г. будут созданы учебные военные центры.
1 декабря 2005 года на военной кафедре ГУАП начато обучение студентов по экспериментальной программе подготовки офицеров для военной службы по контракту по специальности «Метрология и стандартизация».
С 31 мая 2006 года на военной кафедре ГУАП начато обучение студентов по экспериментальной программе подготовки офицеров для военной службы по контракту по специальностям обучения:
1 февраля 2008 года приказом ГУАП на факультете военного образования создана кафедра технической эксплуатации аэрокосмических систем.
1 сентября 2008 года приказом ГУАП созданы и введены в состав факультета военного образования: учебный военный центр при ГУАП и военная кафедра при ГУАП.
С 1 сентября 2009 года факультет военного образования преобразован в институт военного образования, содержащий в своем составе Учебный военный центр с целью подготовки офицеров для последующей военной службы по контракту и военную кафедру для подготовки офицеров запаса.
С 1 сентября 2014 года на военной кафедре при ГУАП кроме программ военной подготовки офицеров запаса реализуются программы подготовки сержантов и солдат запаса.
С 1 сентября 2019 года учебный военный центр и военная кафедра преобразованы в военный учебный центр, осуществляющий подготовку офицеров для военной службы по контракту, а также офицеров и солдат запаса.
