ФПТИ - институт фундаментальной подготовки и технологических инноваций. Институт ФПТИ создан для реализации высшей ступени профессионального образования с учётом дальнейшего обучения студентов в магистратуре по основным техническим и управленческим направлениям подготовки в Университете. С этой целью в университете организована система сквозной подготовки бакалавров-магистров. Студенты института ориентированы на научно-исследовательскую и управленческую деятельность в различных отраслях науки, промышленности, бизнесе. Обучение в институте проводится в соответствии с потребностями ведущих предприятий Санкт-Петербурга, ученые и специалисты которых активно участвуют в учебном процессе.

Отличительная особенность института ФПТИ – тесная связь фундаментальной подготовки в области математики и физики со специализированной подготовкой и ориентация на решение актуальных проблем создания новейшей техники и технологий, конкурентоспособной наукоемкой продукции с учётом экологических требований и норм.

В институте обеспечивается фундаментальная подготовка по физике и математике, механике и управлению качеством, техносферной безопасности, метрологии, инноватике и прикладной математике, которая усилена курсами по теории управления, экономике, теоретическими и практическими дисциплинами по менеджменту качества промышленной продукции и услуг, а также по проблематике управления наукоемкими инновациями.